Die Insel beherbergt das größte Naturschutzgebiet der Welt, in dem der Komodowaran in freier Wildbahn lebt. Darüber hinaus ist das Gebiet Heimat einer Vielzahl unterschiedlicher Arten, darunter mehr als 30 Säugetierarten, 130 Vogelarten, 1.000 Fischarten, 380 Korallenarten, zahlreiche weitere wirbellose Arten sowie 250 Pflanzenarten.