A ilha abriga a maior reserva natural do mundo, onde o dragão-de-komodo vive em estado selvagem. Além disso, a região é lar de uma grande variedade de espécies, incluindo mais de 30 espécies de mamíferos, 130 espécies de aves, 1.000 espécies de peixes, 380 espécies de corais, diversas outras espécies de invertebrados e 250 espécies de plantas.